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《基础医学与临床》（CN 11-2652/R, ISSN 1001-6325）的前身为“生理科学”，于1981年创刊，1984年为国内统一刊物面向全国公开发行，1990年正式更名为“基础医学与临床”。本刊由北京市科学技术协会主管，北京生理科学会主办，中国医学科学院基础医学研究所和北京协和医院共同承办、编辑出版，自2005年起改为月刊，主要刊登基础和临床医学的研究论文、短篇研究报道、新的实验技术与方法、基础与临床学科发展前沿的短篇综述、高等医学教育有关论文、罕见的临床病例分析等。
《基础医学与临床》是目前国内唯一以基础研究与临床实践相结合为主要宗旨的医学综合性期刊。多年来，本刊在催化医学研究新观念的形成，扩展from bench to bedside内涵，促进由临床实践中提出科学问题，经实验室基础研究，再将研究成果反哺临床工作，解决临床实际问题的良性循环过程不断向纵深发展等方面发挥了积极作用，对我国开展转化医学研究（translational medical research）起到了重要作用。
《基础医学与临床》现为中国科技核心期刊和中国医药卫生核心期刊，并一直稳居精品期刊和核心期刊要目总览行列，收录于国内众多重要检索系统及其数据库。2004年入选《中国科技期刊科技精品数据库》。2006年-2008年入选中国科协精品科技期刊工程资助项目（C类），获得国家级科技期刊奖励基金。
本刊面向全国各省市级单位，强调临床与科研紧密结合的一贯办刊宗旨，针对现代医学发展前沿及与人民健康有关的重大问题，积极向广大医学科学工作者介绍医学领域各学科发展的前沿知识、动态和新技术方法；及时刊载国内医学科学工作者的优秀学术论文；为广大作者、读者提供发表作品、获取信息、学术交流的平台，充分发挥促进基础医学与临床研究结合的桥梁作用。
《基础医学与临床》被国内重要检索系统及数据库收录情况：
中国科技论文与引文数据库（中国科学技术信息研究所）
中国科学引文数据库（中国科学院文献情报中心）
中文核心期刊要目总览（北京大学图书馆）
中国生物医学文献光盘数据库（中国医学科学院医学信息研究所）
中国生物医学期刊文献数据库（解放军医学图书馆）
中国生物学文献数据库（中国科学院上海生命科学信息中心）
中文科技期刊数据库（科学技术部西南信息中心）
《中国学术期刊（光盘版）》（清华大学）
2004年《中国知识资源总库》通过对近8000种期刊10年的引文分析与综合评价，本刊作为遴选出的500种优秀科技期刊之一，入选《中国科技期刊科技精品数据库》。
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