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本刊坚持为社会主义服务的方向，坚持以马克思列宁主义、毛泽东思想和邓小平理论为指导，贯彻“百花齐放、百家争鸣”和“古为今用、洋为中用”的方针，坚持实事求是、理论与实际相结合的严谨学风，传播先进的科学文化知识，弘扬民族优秀科学文化，促进国际科学文化交流，探索医学教育、教学及管理诸方面的规律，活跃教学与科研的学术风气，为教学与科研服务。
《福建医科大学学报》是由福建医科大学主管、主办的为公开发行的综合性医药卫生类学术刊物，曾用名为《福建医学院学报》，创刊于1959年，双月刊，规格为国际通用大16开本，国际标准刊号ISSN 1672-4194，国内统一刊号CN 35-1192/R，邮发代号4-66，单价10.00，全年定价60.00。
主要栏目
基础医学、临床医学、预防医学方面的论著、研究简报、临床研究、实验与诊断新技术新方法应用介绍、文献综述、学术讲座、个案报告及学术交流信息等文稿。
获奖情况
1999年福建省高校自然科学学报系统优秀学报评比一等奖
1996年福建省第二届优秀科技期刊评比二等奖
1995年全国高校自然科学学报系统优秀学报评比三等奖
投稿须知
1.1 文稿应具有科学性、前瞻性、逻辑性、实用性、指导性和可读性。
1.2 文稿务求论点明确，论据可靠，数字准确，重点突出，层次清楚，文字精炼，书写工整，引用资料请附参考文献。全文（包括中、英文摘要、图、表和参考文献）字数一般不超过5000字。
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